干细胞治疗月经不调是一种新兴的治疗方法，目前在国内有多家医疗机构提供相关服务。以下是一些值得推荐的医院：

1. 北京协和医院生殖医学中心：该中心是国内较早开展干细胞治疗月经不调的医疗机构之一，拥有丰富的临床经验和先进的技术设备。同时，该中心还与多家国际知名医疗机构合作，引进了多项国际先进技术和理念。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院生殖医学中心：该中心是国内知名的生殖医学中心之一，拥有一支高水平的医疗团队和先进的技术设备。在干细胞治疗月经不调方面，该中心也有着丰富的经验和独特的治疗方法。

3. 广州军区广州总医院生殖医学中心：该中心是国内南方地区较早开展干细胞治疗月经不调的医疗机构之一，拥有一支专业的医疗团队和先进的技术设备。同时，该中心还注重科研创新，不断探索新的治疗方法和技术手段。

以上三家医院都是国内比较知名的干细胞治疗月经不调的医疗机构，患者可以根据自己的实际情况选择适合自己的医院进行治疗。当然，在选择医院时，患者还需要考虑医院的综合实力、医生的专业水平、设备的先进程度等因素。