关于厦门干细胞医院是否合法的问题，根据搜索结果，福建厦门地区确实有多家医院经批准开展干细胞治疗服务。这些医院都具备相关的医疗资质和专业的医疗团队，因此可以认为它们是合法的干细胞医院。

至于好干细胞医院都有哪些，以下是一些在干细胞研究和临床应用方面表现较为突出的医院：

1. 厦门大学附属第一医院：作为福建省的重点学科建设单位，该医院在生物医学工程中心设有专门的干细胞与再生医学研究中心，并在干细胞研究方面取得了一定的成果。

2. 福建医科大学附属协和医院：该医院是福建省血液病研究所的挂靠单位，在造血干细胞移植领域具有强大的研究实力和丰富的临床经验。

3. 厦门大学附属中山医院：作为一所三级甲等综合性医院，中山医院在多个科室领域具有领先地位，其血液内科是福建省最早开展干细胞移植的单位之一。

4. 厦门市中医院：虽然主要以中医为主，但该医院也在探索中医与干细胞结合的新型治疗方法，可能在干细胞研究与中医药结合方面有所建树。

需要注意的是，干细胞治疗目前仍处于临床试验和研究阶段，许多疗法尚未得到广泛应用和大规模商业化。因此，在选择进行干细胞治疗时，患者应充分了解医院的资质、专业团队、治疗方案以及可能的风险和副作用，并在专业医生的指导下做出决策。同时，也要警惕一些非法或不规范的干细胞治疗机构，以免遭受不必要的损失和风险。