间充质干细胞治疗肾功能衰竭是一种前沿的医疗技术，目前全球范围内有多家医疗机构正在进行相关研究或提供基于间充质干细胞的治疗方案。以下是一些可以进行间充质干细胞治疗肾功能衰竭的医院：

1. 北京协和医院：作为国内顶尖的医疗机构之一，其肾脏病医学部在肾病的诊断和治疗方面有着丰富的经验。他们不仅拥有一支由多名专家组成的团队，包括内分泌科医生、肾脏病专家和干细胞研究专家等，还配备了先进的医疗设备和技术，如流式细胞仪、基因测序仪等，可以对患者的病情进行全面的评估和监测。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：该医院的肾脏内科和泌尿外科在肾病的治疗上有着丰富的经验，并且已经开展了多项关于间充质干细胞治疗肾病的临床试验。这些试验结果表明，间充质干细胞治疗在改善患者肾功能、减少蛋白尿、缓解水肿等症状方面取得了显著成效。

3. 北京大学第一医院：该医院的肾病内科在全国排名第一，拥有丰富的临床经验和先进的治疗设备。北京大学第一医院在干细胞治疗方面也处于国内领先水平，其研究团队已经在多项临床试验中验证了干细胞治疗的有效性和安全性。

4. 中国人民解放军总医院：作为全国顶尖的综合性医院之一，中国人民解放军总医院在肾脏病的治疗方面积累了丰富的经验。该院的肾脏病医学部也在积极探索干细胞治疗的应用，并取得了一定的成果。

5. 东部战区总医院：该医院的肾脏病科在全国排名第三，拥有一支高水平的医疗团队。东部战区总医院在干细胞治疗IGA肾病方面也进行了多项研究，并在临床应用中取得了良好的效果。

需要注意的是，虽然间充质干细胞治疗肾功能衰竭在临床上已经取得了一定的成效，但这仍然是一种新兴的治疗方法，其长期疗效和安全性还需要进一步的研究和验证。因此，在选择干细胞治疗时，患者应该充分了解治疗的风险和效果，并在医生的指导下做出决策。同时，由于不同国家和地区对间充质干细胞治疗的认可程度和应用范围存在差异，患者在选择医院时应优先考虑具备相关资质和经验的医疗机构。