在选择使用干细胞治疗风湿病的医院时，患者应优先考虑那些在干细胞研究和临床应用方面具有深厚背景和丰富经验的医疗机构。以下是一些推荐的医院：

1. 北京协和医院：作为国内顶尖的综合性医院之一，北京协和医院在干细胞研究与应用方面具有深厚的基础。其风湿免疫科是国内最早开展干细胞治疗风湿热的科室之一，拥有丰富的临床经验和先进的治疗技术。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院在风湿病学领域享有盛誉，其风湿免疫科是国内领先的风湿病诊疗中心之一。医院注重科研创新，不断探索新的治疗方法和技术，以提高治疗效果。

3. 广州医科大学附属第一医院：该医院在干细胞治疗领域具有较高的知名度，其风湿免疫科是国家重点学科之一。医院拥有一流的医疗设备和技术，能够为患者提供全方位的干细胞治疗服务。

4. 四川大学华西医院：华西医院是中国西部地区最具影响力的医疗机构之一，其在干细胞治疗风湿病方面也取得了显著成果。医院拥有一支由多名资深专家组成的医疗团队，他们在干细胞治疗领域有着深入的研究和丰富的实践经验。

5. 中国人民解放军总医院（301医院）：作为全军最高级别的医疗机构之一，301医院在干细胞治疗风湿病方面具有较强的实力。医院拥有一支由多名高级职称专家组成的医疗团队，他们在干细胞治疗领域有着丰富的经验和深厚的学术造诣。

需要注意的是，虽然这些医院在干细胞治疗风湿病方面表现出色，但干细胞治疗仍处于研究和发展阶段，每个患者的病情都是独特的，治疗效果可能会有所不同。因此，在选择医院时，建议咨询医生，了解当前的临床试验情况，以及治疗可能的风险和收益。同时，由于干细胞治疗可能涉及较高的费用，还需要考虑医疗保险覆盖情况和个人经济能力。