小儿脑萎缩是一种复杂的神经系统疾病，干细胞治疗作为一种前沿的医疗技术，在治疗小儿脑萎缩方面展现出了一定的潜力。然而，由于该技术仍处于发展阶段，选择合适的医院进行治疗至关重要。以下是一些在干细胞研究与治疗领域具有一定声誉和实力的医院，供参考：

1. 北京大学第三医院：作为中国的医疗机构之一，北医三院在干细胞研究方面有着深厚的积累，其神经内科和儿科在小儿脑萎缩的治疗上具有较高的专业水平。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院是中国最早开展干细胞临床研究的医院之一，其神经科在小儿神经系统疾病的治疗上有丰富的经验。

3. 浙江大学医学院附属儿童医院：该医院在儿科疾病治疗方面享有很高的声誉，尤其是在小儿神经疾病的研究和治疗上有一定的影响力。

4. 北京协和医院：作为中国最著名的综合性医院之一，北京协和医院在神经科学领域具有很高的声誉，能够为患者提供全面的治疗方案。

5. 北京天坛医院：天坛医院神经外科是国内的神经疾病诊疗中心之一，拥有丰富的临床经验和先进的医疗设备，对于采用干细胞疗法治疗神经系统疾病也有一定的探索。

6. 上海华山医院：华山医院神经内科是国家重点学科，拥有一支高水平的专业团队，在神经系统疾病的诊断与治疗方面积累了丰富的经验，并设有专门的干细胞研究实验室。

7. 广州中山大学附属第一医院：中山一院神经科是国内较早开展干细胞治疗研究的单位之一，与国内外多家科研机构保持紧密合作，推动了多项干细胞治疗项目的临床试验。

8. 四川大学华西医院：华西医院神经病学研究所长期从事神经系统疾病的基础与临床研究，尤其在干细胞治疗领域取得了显著进展。

需要注意的是，干细胞治疗小儿脑萎缩仍处于发展阶段，其安全性和有效性需要更多的临床试验来验证。因此，在选择医院时，除了考虑医院的综合实力外，还要关注医生的专业水平和经验、医院的设施和技术等方面。同时，患者及其家属应与专业医疗团队充分沟通，了解所有可能的风险和收益，并在正规医疗机构内由具备相应资质的专业人员实施治疗，确保治疗的安全性和有效性。