湖北省武汉市作为中国中部地区的重要城市，在干细胞研究和应用领域拥有丰富的资源和先进的技术。以下是一些在武汉市内合法且知名的干细胞研究机构和医院：

1. 华中科技大学同济医学院附属协和医院

简介：该医院是湖北省最大的综合性三甲医院之一，其干细胞研究中心是国内最早开展干细胞临床研究和应用的机构之一。

特色：拥有一流的干细胞实验室和技术团队，能够开展多种类型的干细胞治疗，尤其在神经系统疾病、心血管系统疾病和免疫系统疾病的治疗方面取得了显著成果。

2. 武汉大学人民医院

简介：作为湖北省最大的三级甲等综合医院之一，武汉大学人民医院设有干细胞研究中心，致力于干细胞的基础研究和临床应用。

特色：该中心不仅进行基础研究，还致力于干细胞转化研究，为疾病治疗提供创新解决方案。拥有完善的实验设备和技术力量，可以进行各种干细胞的培养、分离、鉴定、储存等工作。

3. 华中科技大学同济医学院附属同济医院

简介：同济医院也是湖北省重要的干细胞临床研究基地之一，从2018年起开始进行胚胎干细胞来源的功能干细胞的相关临床研究工作。

特色：该医院在干细胞临床研究数量和质量上均处于华中地区领先水平，并设有华中干细胞库，主要致力于人胚干细胞和人多能干细胞的制备、干细胞药物的开发和干细胞库的建立。

4. 武汉市第一医院

简介：武汉市第一医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合医院，其干细胞治疗中心能够开展干细胞移植治疗各种疾病。

特色：该中心在干细胞移植治疗血液病、神经系统疾病等方面积累了丰富的经验，并已成功治愈了多例患者。

5. 武汉生物工程学院干细胞与再生医学研究院

简介：依托于武汉生物工程学院，是专注于干细胞生物学、细胞治疗技术及再生医学的研究的科研机构。

特色：在干细胞生物学、细胞治疗技术及再生医学的研究方面具有深厚的学术背景和丰富的实践经验。

总的来说，在选择干细胞治疗时，患者应充分了解相关信息、评估自身健康状况，并咨询专业医生意见。同时，选择正规渠道进行治疗，以保障自身权益不受损害。