干细胞移植治疗亚急性甲状腺炎的费用因多种因素而异，包括患者的具体病情、治疗方案的选择、医院的等级和地理位置等。一般来说，干细胞移植治疗的费用较高，可能达到数万元甚至更高。

首先，患者的病情严重程度是影响费用的重要因素之一。如果患者的病情较轻，可能只需要进行一次干细胞移植手术即可治愈，费用相对较低；而如果患者的病情较重，可能需要多次手术或联合其他治疗方法，费用会相应增加。

其次，治疗方案的选择也会影响费用。目前，干细胞移植治疗亚急性甲状腺炎的方法有多种，如自体骨髓干细胞移植、异体骨髓干细胞移植等。不同的治疗方法所需的设备和技术要求不同，因此费用也会有所差异。

此外，医院的等级和地理位置也是影响费用的因素之一。一般来说，高级别的医院和位于大城市的医院收费较高，而低级别的医院和位于偏远地区的医院收费较低。

总之，干细胞移植治疗亚急性甲状腺炎的费用因多种因素而异，具体费用需要根据患者的具体情况来确定。建议患者在选择治疗方案时，要充分了解各种治疗方法的优缺点和费用情况，以便做出明智的决策。