在选择南京的干细胞医院时，患者应综合考虑医院的资质认证、医生团队、技术设备、患者评价、后续支持、地理位置、费用透明度以及个性化治疗方案等因素。以下是对南京几家主要进行干细胞治疗的医院的简要介绍和分析：

1. 南京鼓楼医院

综合实力：南京鼓楼医院是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性大型三级甲等医院，也是全国首批30家干细胞临床备案机构之一。该院在干细胞基础研究及临床转化上颇有建树，特别是在肝功能衰竭、子宫内膜修复、红斑狼疮等疾病的干细胞治疗方面取得了显著成果。

专业团队与技术：鼓楼医院建立了完备的临床级干细胞制备中心，成功制备多种临床级脐带间充质干细胞，并与多个临床科室合作开展临床治疗性试验项目。其专家团队在血液系统疾病、免疫系统疾病以及神经系统损伤的干细胞治疗上积累了丰富的临床经验。

2. 江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）

技术实力：作为江苏省最大的综合性医院之一，江苏省人民医院的干细胞治疗中心拥有强大的技术实力和丰富的临床经验。该中心提供自体骨髓干细胞移植、脐带血干细胞移植等多种干细胞治疗方案，对许多疑难杂症有良好的治疗效果。

科研创新：医院注重科研创新，不断推动干细胞治疗技术的临床转化和应用。例如，与江苏睿源生物技术有限公司合作开展的人脐带间充质干细胞注射液治疗狼疮性肾炎的临床试验，已显示出良好的安全性和初步疗效。

3. 东部战区总医院

公立三甲医院优势：作为公立三甲医院，东部战区总医院在干细胞移植领域也有一定的实力和技术优势。该院不仅拥有先进的医疗设备和技术力量，还注重跨学科的合作与交流，通过与其他领域的专家合作，共同推动干细胞技术的创新与发展。

特色治疗：东部战区总医院的干细胞治疗中心专注于创伤修复、烧伤康复以及一些罕见病的治疗研究，利用最新的科研成果帮助患者恢复健康。

4. 南京医科大学附属口腔医院

口腔领域优势：南京医科大学附属口腔医院是一家中西医结合的特色医院，其干细胞中心在口腔领域的干细胞治疗方面具有独特的优势。该医院不仅在口腔领域的干细胞治疗方面有着深厚的技术积累，还在其他多种疾病的干细胞治疗中取得了显著成效。

适合人群：需要进行口腔领域干细胞治疗或其他多种疾病干细胞治疗的患者，南京医科大学附属口腔医院是一个值得考虑的选择。

5. 南京市儿童医院

儿科领域优势：南京市儿童医院以其在儿科领域的专业性而闻名，能够为儿童提供多种类型的干细胞培养和治疗。该院的干细胞实验室能够进行多种类型的干细胞培养和治疗，包括遗传性疾病、免疫缺陷病、神经发育性疾病等。

综上所述，南京的干细胞医院在数量和质量上都表现出色，为患者提供了多样化的治疗选择。在选择医院时，患者应优先考虑具备相应资质和经验的机构，并了解治疗的具体方案和技术流程等信息。同时，也要关注医院的设备是否先进、医资力量是否雄厚以及服务态度是否良好。此外，建议患者先去医院进行详细的咨询和检查，然后根据自身情况做出最合适的决定。