在南京，有多家医院在干细胞治疗领域表现出色，为患者提供了高质量的医疗服务。以下是一些值得推荐的医院：

1. 南京鼓楼医院：作为一所集医疗、教学、科研为一体的综合性大型三级甲等医院，南京鼓楼医院的干细胞研究团队在国内外享有盛誉。该医院在间充质干细胞（MSC）治疗方面取得了多项突破，如异体间充质干细胞治疗难治性红斑狼疮的技术已获得江苏省科学技术奖一等奖，并显著提高了患者的生存率。此外，南京鼓楼医院还成功应用干细胞技术治疗卵巢早衰、宫腔粘连等多种病症，并在糖尿病治疗方面取得显著进展。

2. 江苏省人民医院：作为南京医科大学第一附属医院，江苏省人民医院是江苏省属三级甲等综合性医院，承担着医疗、教学、科研等多项任务。其干细胞研究中心致力于各种罕见病的治疗研究，并在血液系统疾病、免疫系统疾病等领域取得了显著成果。作为全国首批干细胞移植备案机构之一，江苏省人民医院在造血干细胞移植方面积累了丰富经验。

3. 东部战区总医院：东部战区总医院历史悠久，规模庞大，医疗设备先进，技术力量雄厚。该医院在血液病和免疫系统疾病的干细胞治疗方面有着较高的造诣，成功实施了多例高难度的造血干细胞移植手术。

4. 南京市第一医院：南京市第一医院是南京市内知名的三甲综合性医院，也是南京医科大学的重要附属医院之一。其干细胞治疗中心不仅能够开展造血干细胞移植等传统项目，还在间充质干细胞治疗等新兴领域进行了深入探索。

5. 南京医科大学附属南京儿童医院：这是一家专门治疗儿童疾病的医院，拥有世界一流的医疗技术和设施。该医院在儿童血液病及恶性肿瘤的干细胞移植方面处于国内领先地位，多次完成高难度的干细胞移植手术，并取得了显著的治疗效果。

6. 东南大学附属中大医院：作为南京医科大学的重要附属医院，中大医院在医学研究和临床治疗方面同样具有较强的实力。虽然该医院在干细胞移植领域的具体排名可能稍逊于上述几家医院，但其医疗水平和服务质量仍然值得信赖。

南京有多家医院在干细胞治疗领域具有较高的专业水平和丰富的临床经验。患者在选择医院时，应充分了解各医院的专业水平、设备设施、医护人员素质以及治疗方案等信息，以便做出明智的选择。也应注意干细胞治疗仍存在一些挑战和限制，如治疗成本高、技术复杂性以及潜在的伦理问题等。在选择干细胞治疗时，患者应充分了解相关信息并咨询专业医生的意见。