江苏省南京市在干细胞治疗领域内拥有多家知名且专业的医疗机构，这些机构在干细胞移植技术方面处于国内乃至国际的前沿水平，为众多患者提供了高质量的医疗服务。

南京鼓楼医院是南京地区最早开展干细胞治疗研究的三甲医院之一，其干细胞临床应用研究始于20世纪90年代末。该医院的血液科和风湿免疫科在干细胞移植领域积累了丰富的经验，成功实施了多例造血干细胞移植手术，治疗范围涵盖白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤等恶性疾病，以及系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等自身免疫性疾病。鼓楼医院还建立了符合国际标准的细胞治疗中心，确保了治疗过程的安全性和有效性。

东部战区总医院（原南京军区总医院）也是一家在干细胞治疗领域具有深厚底蕴的医疗机构。作为一所大型综合性三级甲等医院，东部战区总医院在再生医学领域的研究和应用达到了国内领先水平。特别是在神经退行性疾病如帕金森病、脊髓损伤的干细胞治疗方面取得了显著进展，为许多患者带来了新的希望。

此外，南京医科大学附属南京医院（南京市第一医院）也在积极探索干细胞治疗技术，尤其在心血管疾病、糖尿病足等慢性疾病的干细胞治疗研究中展现出良好的前景，为患者提供了更多的治疗选择。

至于哪家医院更“专业”，实际上，这几家医院在各自的优势领域内都有着不俗的表现。选择最适合自己的医院，需要综合考虑医院的专业特长、医生团队的经验、治疗案例的成功率以及个人的具体情况。建议患者在决定前，详细咨询各医院的相关科室，了解最新的治疗方案和可能的风险，同时也可以寻求多位专家的意见，做出更为明智的选择。