在南京，干细胞研究和治疗领域的发展迅速，多家医疗机构和公司在干细胞的临床应用和基础研究中取得了显著成就。以下是一些在行业内具有较高知名度和影响力的干细胞机构：

1. 南京鼓楼医院：作为南京市最早开展干细胞治疗的医疗机构之一，南京鼓楼医院拥有专业的医疗团队和先进的设施设备。该院在多个领域开展了干细胞治疗的研究和应用，包括神经系统疾病、心血管疾病、血液系统疾病等。其科研团队在施晓雷教授和丁义涛教授的带领下，开展了多项干细胞相关技术的研究，并取得了显著成果。

2. 江苏省人民医院（南京医科大学第一附属医院）：以其强大的综合实力，在干细胞存储、研发及临床应用方面全面布局，为患者提供全方位的干细胞医疗服务。

3. 东南大学医学院附属中大医院再生医学研究中心：专注于干细胞治疗的临床前研究和临床试验，特别是在神经退行性疾病和心血管疾病的治疗上取得了突破性进展。

4. 南京医科大学附属南京医院（南京市第一医院）：也是干细胞研究的重要基地，设有专门的干细胞治疗中心，不仅开展多项干细胞临床治疗项目，还积极参与国际合作，推动干细胞技术的全球化发展。

5. 南京中医药大学及其附属医院：从中医药角度出发，探索干细胞与传统中药结合的新疗法，为传统医学的现代化发展提供了新思路。

此外，还有一些在干细胞领域具有较强科研实力和技术储备的公司，如南京源品生物科技有限公司、南京华大基因科技服务有限公司、南京赛百盛生物科技有限公司等。这些公司在干细胞储存、研发和临床应用方面有着深厚的技术积累，为南京乃至全国的干细胞产业发展提供了有力支持。

需要注意的是，干细胞治疗仍然是一种高技术含量的治疗方式，需要具备相应的技术条件和资质。因此，在选择干细胞治疗时，患者应充分了解治疗的具体方案、技术流程、费用等信息，并与医生进行充分沟通和评估，以确保治疗的安全性和有效性。同时，由于干细胞领域的研究日新月异，新的公司和研究成果不断涌现，因此，对于任何公司的评价都应以最新的信息为准。