湖北省武汉市作为中国中部地区的重要城市，在干细胞研究和应用领域拥有丰富的资源和先进的技术。以下是一些在武汉市内合法且知名的干细胞研究机构和医院：

1. 华中科技大学同济医学院附属协和医院

简介：华中科技大学同济医学院附属协和医院是湖北省最大的综合性三甲医院之一，其干细胞研究中心是国内最早开展干细胞临床研究和应用的机构之一。该中心拥有一支由多名国内外知名专家组成的团队，开展了多项干细胞临床试验。

特色：该中心在骨髓移植、血液病、肝病等多个领域进行了广泛的干细胞治疗研究，并取得了显著成果。

2. 武汉大学人民医院

简介：武汉大学人民医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等医院，其干细胞与再生医学中心是国内较早开展干细胞临床研究和应用的机构之一。该中心不仅进行基础研究，还致力于干细胞转化研究，为疾病治疗提供创新解决方案。

特色：该中心拥有完善的实验设备和技术力量，可以进行各种干细胞的培养、分离、鉴定、储存等工作，并在多个疾病领域进行了干细胞治疗的研究和临床试验。

3. 武汉大学中南医院

简介：武汉大学中南医院干细胞研究中心成立于2006年，是我国较早从事干细胞研究与应用的机构之一。中心拥有一支专业的科研团队，开展了一系列关于干细胞的基础研究与临床应用研究，尤其在心血管疾病和神经系统疾病的干细胞治疗方面取得了重要进展。

特色：该中心在干细胞生物学、细胞治疗技术及再生医学的研究方面具有深厚的学术背景和丰富的实践经验。

4. 武汉市第一医院

简介：武汉市第一医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型综合医院，其干细胞治疗中心拥有一支专业的干细胞团队。该中心能够开展干细胞移植治疗各种疾病，如血液病、神经系统疾病等。

特色：该中心在干细胞移植治疗方面积累了丰富的经验，并成功治愈了多例患者。

5. 武汉市第三医院

简介：武汉市第三医院是一家以肿瘤治疗为主的大型专科医院，其干细胞治疗中心主要开展脐带血干细胞的采集、保存和应用。该中心拥有一套完整的脐带血库管理系统和先进的实验设备。

特色：该中心在脐带血干细胞的采集、保存和应用方面具有丰富的经验和技术实力，为患者提供了优质的服务。

6. 武汉生物工程学院干细胞与再生医学研究院

简介：武汉生物工程学院干细胞与再生医学研究院依托于武汉生物工程学院，是专注于干细胞生物学、细胞治疗技术及再生医学的研究的科研机构。该研究院为相关疾病的治疗提供了可能的治疗手段。

特色：该研究院在干细胞生物学、细胞治疗技术及再生医学的研究方面具有深厚的学术背景和丰富的实践经验。

总的来说，在选择干细胞治疗时，患者应充分了解相关信息、评估自身健康状况，并咨询专业医生意见。同时，选择正规渠道进行治疗，以保障自身权益不受损害。