重庆市在干细胞研究和应用领域拥有多家专业机构，这些机构在干细胞的基础研究、临床应用以及产业化推广等方面发挥着重要作用。以下是一些主要的干细胞研究机构：

1. 重庆市红汇干细胞库：这是重庆市红十字会牵头组建的本地最大的干细胞储存库，业务涵盖脐带和脐带血干细胞储存及干细胞临床应用研究。该库不仅提供干细胞的采集、制备、检测和储存服务，还致力于干细胞技术的临床转化和应用研究。

2. 重庆医科大学附属儿童医院：作为国家卫生健康委员会指定的全国首批儿童血液病定点诊治中心之一，该院在造血干细胞移植领域具有丰富的经验，为西南地区乃至全国的患儿提供了优质的医疗服务。

3. 重庆医科大学附属第二医院：该院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性医院，在干细胞治疗领域也有一定的研究和临床应用基础。

4. 重庆国际生物城：作为全市唯一的国家战略性新兴产业集群和生物医药重点关键产业园，重庆国际生物城积极与国内外顶级专家与相关医疗机构联系，推动干细胞项目的发展。例如，三界元生物科技有限责任公司就落户于此，计划打造中国最全面的干细胞生产基地。

5. 重庆干细胞治疗工程技术研究中心：该中心由重庆医科大学附属儿童医院承建，主要开展干细胞资源保存、产品研发生产、干细胞技术临床应用等方面的研究工作。中心已建成万级洁净度GMP标准的干细胞生物资源库，并开展了多项干细胞定向诱导分化技术的研究。

6. 重医附二院：该院在干细胞治疗领域也有显著成就，如成功获批全市首家干细胞临床研究备案机构，并在儿童难治性疾病的干细胞治疗方面处于国内领先水平。

7. 重庆大学附属肿瘤医院：该院在干细胞治疗恶性肿瘤方面也取得了一定的进展，如成功实施了CAR-T细胞治疗淋巴瘤等案例。

8. 重庆渝药创新生态链：这是由重庆市药监局发起成立的组织，旨在推动包括干细胞在内的医药项目的研发和应用。通过整合资源、搭建平台，促进干细胞技术的产业化发展。

此外，还有一些生物技术公司和科研机构也在重庆市从事干细胞相关的研究和开发工作，如三界元生物科技有限责任公司等。这些机构共同推动了重庆市干细胞领域的发展和进步。