间充质干细胞治疗进行性肌营养不良症是一种新兴的治疗方法，目前在国内已经有多家医院开展了相关研究和应用。以下是一些可以进行间充质干细胞治疗进行性肌营养不良症的医院：

1. 北京协和医院：作为国内著名的综合性医院之一，北京协和医院在干细胞治疗领域有着丰富的经验和技术积累。该医院的干细胞治疗中心是国内最早开展间充质干细胞治疗进行性肌营养不良症的单位之一。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：该医院拥有一支专业的干细胞治疗团队，其干细胞治疗中心也是国内较早开展间充质干细胞治疗进行性肌营养不良症的单位之一。

3. 复旦大学附属华山医院：该医院的干细胞治疗中心是国内较早开展间充质干细胞治疗进行性肌营养不良症的单位之一，其技术水平和临床经验都非常丰富。

以上三家医院都是国内知名的综合性医院，拥有先进的设备和技术，同时也有专业的干细胞治疗团队和丰富的临床经验。如果您需要进行间充质干细胞治疗进行性肌营养不良症，可以考虑前往这些医院咨询和治疗。