在中国，干细胞移植治疗自身免疫性肝病的医院选择较多。以下是一些可以进行干细胞移植治疗的医院：

1. 北京协和医院：作为国内知名的综合性医院之一，北京协和医院拥有先进的医疗设备和技术力量，能够为患者提供高质量的医疗服务。该医院的干细胞移植中心是国内较早开展干细胞移植治疗的单位之一，具有丰富的临床经验和技术积累。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院是国内著名的综合性医院之一，其干细胞移植中心也是国内较早开展干细胞移植治疗的单位之一。该医院拥有一支高水平的医疗团队和先进的设备，能够为患者提供个性化、全方位的治疗方案。

3. 复旦大学附属华山医院：华山医院是国内著名的综合性医院之一，其干细胞移植中心也是国内较早开展干细胞移植治疗的单位之一。该医院拥有一支高水平的医疗团队和先进的设备，能够为患者提供个性化、全方位的治疗方案。

以上三家医院都是国内较为知名的医疗机构，具有较高的声誉和专业水平。当然，还有其他一些医院也可以进行干细胞移植治疗，具体选择哪家医院需要根据患者的具体情况和需求来决定。