在重庆市，有多家医院在干细胞治疗领域具有显著的优势和特色。以下是一些备受好评的医院：

1. 重庆医科大学附属儿童医院：该医院与中源协和细胞基因工程股份有限公司合作建立了重庆市干细胞库，是集干细胞储存、基因检测、研发于一体的干细胞资源库。医院在儿童难治性疾病的干细胞治疗方面处于国内领先水平，特别是在儿童缺血缺氧性脑损伤、儿童难治性肺部疾病、儿童原发性免疫缺陷病、儿童血液系统疾病等方面形成了特色研究方向。

2. 重庆医科大学附属第二医院：该医院成功获批全市首家干细胞临床研究备案机构，并创新了三方联动的发展模式，包括“教学医院+工程技术研究中心+生物技术公司”三方联动，以及与上海赛傲生物、山西锦波生物等生物技术高科技企业合作。医院在干细胞临床研究和应用方面取得了显著成果，特别是在人羊膜上皮细胞等细胞产品的治疗上进行了多项前沿性临床研究。

3. 重庆西南医院（第三军医大学第一附属医院）：作为一所拥有丰富教学和科研资源的大型医院，西南医院在干细胞治疗领域有着深厚的积累。其科研团队在干细胞生物学、细胞移植技术等方面取得了多项成果，对多种疾病的治疗展现出良好的潜力。

4. 重庆新桥医院：该医院是一家集临床、教学、科研、预防为一体的大型综合性医院。其干细胞治疗技术先进，医生团队经验丰富，能够为患者提供全方位的干细胞治疗服务。

需要注意的是，干细胞治疗作为一种前沿的医疗技术，其效果和安全性可能因个体差异而异。因此，在选择医院和治疗方案时，患者应充分了解相关信息，并在专业医生的指导下做出决策。同时，确保所选医院具备合法的医疗资质和服务质量。