间充质干细胞（MSCs）治疗运动神经元病（MND）是一种前沿的医疗技术，目前仍处于研究阶段。国内外已有一些医疗机构在开展相关的临床研究，以下是一些在该领域有研究的医院：

1. 国内医院

- 北京大学第三医院：该医院在干细胞领域有着深入的研究，并且已经在某些方面取得了显著成果，拥有强大的科研实力和技术支持。

- 上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院在干细胞研究方面有深厚的积累，且拥有先进的医疗设备和技术，开展了相关的临床研究。

- 复旦大学附属华山医院：华山医院神经内科在全国有很高的声誉，其在干细胞治疗神经系统疾病方面也有一定的研究。

- 中国医学科学院北京协和医院：作为国内的医疗机构，协和医院在神经科学领域的研究和临床实践都具有很高的水平，包括干细胞治疗的研究。

- 广州中山大学附属第三医院：该医院在干细胞治疗神经退行性疾病方面有较多的临床研究，对运动神经元病的治疗也有一定探索。

- 中国医学科学院北京天坛医院：天坛医院神经科在国内享有盛誉，对干细胞治疗神经疾病有深入研究，包括运动神经元病。

- 浙江大学医学院附属第一医院：该医院在干细胞治疗疾病方面有较为前沿的研究，对运动神经元病等神经性疾病的治疗也有关注。

2. 国外医院及研究机构

- 美国约翰霍普金斯大学医学院：该学院的研究团队在干细胞治疗方面有着深入的研究，并取得了一定成果，包括在运动神经元病治疗方面的探索。

- 英国剑桥大学：剑桥大学的研究人员也在积极探索干细胞治疗运动神经元疾病的潜力，进行了多项相关研究。

- 日本京都大学iPS细胞研究所：该研究所是全球的干细胞研究机构之一，尤其在诱导多能干细胞（iPSCs）的应用方面取得了显著进展，对运动神经元病的治疗也有相关研究。

- 美国梅奥诊所：梅奥诊所也是一家在干细胞治疗领域有深入研究的医疗机构，其研究成果可能对运动神经元病的治疗提供新的思路。

需要注意的是，虽然这些医院和研究机构在干细胞治疗运动神经元病方面有一定的研究和实践，但目前该治疗方法仍处于临床试验阶段，其疗效和安全性还需进一步验证。因此，患者在选择接受干细胞治疗时，应充分了解治疗的风险和可能的效果，遵循医嘱，谨慎决策。同时，由于干细胞治疗可能涉及较高的费用，也需要考虑自身的经济承受能力。