在巴彦淖尔，有多家医院在不孕不育干细胞治疗领域表现出色。以下是一些值得推荐的医院：

1. 巴彦淖尔市中心医院：作为当地规模较大、设备先进的综合性医院之一，其生殖医学中心拥有专业的医疗团队和先进的实验室设备，能够进行精准的诊断和治疗。该中心不仅具备常规的辅助生殖技术，还开展了干细胞治疗的研究与应用，为患者提供了更多的治疗选择。

2. 巴彦淖尔市妇幼保健院：专注于妇女儿童健康领域，其生殖健康科在不孕不育治疗方面积累了丰富的经验。该科室注重个性化治疗方案的制定，根据每位患者的实际情况，结合传统治疗方法与前沿技术，如干细胞疗法，力求达到最佳疗效。

3. 巴彦淖尔市第一人民医院：设有专门的生殖医学科，近年来积极引进国内外先进的生殖技术和设备，尤其是在干细胞治疗领域取得了显著进展。通过与国内外专家的合作交流，不断提升自身的诊疗水平和服务质量。

4. 内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院：虽然位于包头市，但作为内蒙古地区的重要医疗机构之一，其生殖医学中心在不孕不育治疗方面具有较高的知名度和影响力。该中心拥有一支经验丰富的专业团队和先进的医疗设备，能够为患者提供全面的诊疗服务。

5. 内蒙古自治区中医医院巴彦淖尔分院：作为自治区级医院，他们在中医和中西医结合治疗方面有一定优势，对于一些与干细胞相关的中医治疗方案可能会有所研究。

6. 巴彦淖尔市医院：该医院在干细胞移植领域取得了显著成就，特别是在自体和异基因造血干细胞移植方面。医院血液内科自2012年起就开始为开展移植工作做准备，并成功完成了多例复杂病例的移植手术。此外，巴彦淖尔市医院还积极与外部专家进行合作与交流，不断提升自身的系统化、专业化诊疗水平。

在选择医院时，除了考虑医院的资质、医生团队和设备设施外，还需要关注医院的服务质量和患者评价。建议患者可以通过网络平台或向已接受过治疗的患者咨询，了解医院的实际服务水平和效果。由于医疗技术和政策可能随时间发生变化，建议直接联系相关医院或医疗机构以获取最新和最准确的信息。