作为医生，我深知干细胞移植技术在医学领域的重要性和潜力。南京地区有多家医院在干细胞移植方面具有较高的专业水平和丰富的临床经验，以下是一些值得推荐的医院：

1. 江苏省人民医院：作为国家临床研究基地之一，该院在造血干细胞移植方面有着极高的声誉，成功进行了大量骨髓移植和外流干细胞移植手术。此外，医院还注重科研创新，与江苏睿源生物技术有限公司合作开展的人脐带间充质干细胞注射液治疗狼疮性肾炎的临床试验，已显示出良好的安全性和初步疗效。

2. 南京鼓楼医院：这是全国知名的三级甲等综合性医院，其血液科在造血干细胞移植领域有着深厚的积累，不仅在成人疾病的治疗上有丰富经验，也在儿童白血病的造血干细胞移植方面取得了显著成果。此外，鼓楼医院还在干细胞修复子宫内膜、治疗红斑狼疮等免疫疾病方面取得了显著成绩。

3. 南京市中医院：这是一家全国著名的中医医院，将中西医结合，引入了西医的先进技术，为患者提供了更多的治疗选择。医院设有干细胞研究室，拥有一支专业的干细胞移植团队，能够为患者提供个性化的治疗方案。

4. 南京军区总医院：作为一家军队背景的大型综合医院，该医院在血液科疾病的治疗上具有很高的专业水平，尤其在造血干细胞移植领域有着丰富的经验和先进的设备。

5. 南京医科大学第二附属医院：该医院的血液科也具有较高的技术水平，尤其在异基因造血干细胞移植方面有独到之处，对难治性、复发性血液病的治疗有丰富的经验。

6. 南京市红十字会医院干细胞治疗中心：这是一家专门开展干细胞治疗的医疗机构，拥有一流的技术水平和先进的治疗设施，主要开展间充质干细胞治疗、CAR-T细胞治疗等业务。

总之，在选择干细胞移植医院时，患者应综合考虑医生的专业水平、医疗设备、服务质量以及患者评价等因素。同时，由于干细胞治疗涉及伦理和法律问题，确保选择正规合法的医疗机构非常重要。