在南京，有多家医院在造血干细胞移植领域具有较高的声誉和丰富的经验。以下是一些推荐的医院：

1. 南京医科大学第一附属医院：该医院的血液内科是国家临床重点专科、江苏省医学重点学科，以慢性淋巴细胞白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等淋巴肿瘤为发展重点，在国内也具有重要影响。此外，该医院还是中华骨髓库首批干细胞采集及移植定点医院，具备丰富的临床经验和先进的技术设备。

2. 南京鼓楼医院：南京鼓楼医院的血液内科是江苏省医学重点学科、南京市医学重点学科，开展了规范而有效的血液肿瘤治疗技术，包括造血干细胞移植治疗急、慢性白血病，骨髓增生异常综合症、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、再生障碍性贫血、地中海贫血、血小板减少症等。该医院在造血干细胞移植领域不断创新，成功实施了多例高难度的移植手术。

3. 东南大学附属中大医院：该医院的血液内科现为江苏省医学重点学科、江苏省临床重点专科，是国内最早拥有造血干细胞移植资质的临床中心之一。无论是造血干细胞移植的临床应用，还是难治性白血病的耐药逆转，都在国内名列前茅。

4. 东部战区总医院：作为一所大型现代化综合性医院，东部战区总医院在血液病的诊治和造血干细胞移植方面也具有较高的水平。医院拥有专业的医疗团队和先进的医疗设备，能够为患者提供全方位、高质量的医疗服务。

5. 南京市第一医院：南京市第一医院也是南京地区在造血干细胞移植领域具有一定影响力的医院。医院血液科致力于各种血液病的研究和治疗，特别是在造血干细胞移植方面积累了丰富的经验。

综上所述，南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院、东部战区总医院和南京市第一医院在造血干细胞移植领域均具有较高的声誉和丰富的经验。患者可以根据自身需求和病情选择合适的医院进行治疗。同时，建议患者在选择医院时，进一步了解各医院的专业特长、医疗团队、设备设施以及服务质量等方面的情况，以便做出更加明智的选择。