在处理肌肉萎缩这一复杂且挑战性高的医疗状况时，选择一家专业且经验丰富的医院至关重要。根据复旦版2021年医院专科榜发布的排名，以下是几家在肌肉萎缩治疗领域表现突出的医院：

1. 北京医院

- 科室设置与荣誉：北京医院在神经内科和神经外科方面拥有强大的专业团队，连续多年在复旦版医院排名中名列前茅。

- 推荐理由：作为国家老年医学中心，北京医院在神经退行性疾病，包括肌肉萎缩的治疗上有深入研究和丰富经验。

2. 首都医科大学附属北京天坛医院

- 科室设置与荣誉：天坛医院的神经病学中心是国内领先的神经科学研究与治疗基地，尤其在神经肌肉疾病的诊治上具有显著优势。

- 推荐理由：该院神经内科和神经外科的强大综合实力，为肌肉萎缩患者提供了全面的诊断和治疗选项。

3. 复旦大学附属华山医院

- 科室设置与荣誉：华山医院以其神经科的高水平医疗服务闻名，拥有多个国家级重点学科和实验室。

- 推荐理由：华山医院在神经科学领域的深厚积累，特别是在运动神经元疾病和其他神经肌肉疾病的治疗上，具有国内领先水平。

4. 中山大学附属第一医院

- 科室设置与荣誉：中山一院的神经内科是国家重点学科，对肌肉萎缩等神经系统疾病有深入研究。

- 推荐理由：该院在神经肌肉疾病的综合治疗和科研方面取得了多项成就，为患者提供了多学科联合诊疗服务。

5. 四川大学华西医院

- 科室设置与荣誉：华西医院的神经内科和神经外科均居国内前列，尤其在疑难神经肌肉疾病的诊治上有独到之处。

- 推荐理由：华西医院的综合医疗实力和科研能力，使其在肌肉萎缩的精准医疗和个性化治疗方面具有优势。

6. 中国人民解放军总医院

- 科室设置与荣誉：作为国内顶尖的综合性医院，301医院在神经内科和神经外科领域具有雄厚的医疗资源和丰富的临床经验。

- 推荐理由：301医院在神经肌肉疾病的治疗上采用多学科协作模式，为患者提供全方位的医疗服务。

7. 中南大学湘雅医院

- 科室设置与荣誉：湘雅医院的神经内科在国内享有盛誉，尤其在神经肌肉疾病的研究和治疗方面成绩显著。

- 推荐理由：湘雅医院在肌肉萎缩的病因诊断和创新治疗方面具有丰富的经验，为患者提供了多样化的治疗选择。

8. 上海交通大学医学院附属瑞金医院

- 科室设置与荣誉：瑞金医院的神经内科是上海市的重点学科，对肌肉萎缩等神经肌肉疾病有深入研究。

- 推荐理由：瑞金医院在神经肌肉疾病的综合管理和康复治疗方面具有丰富的经验，为患者提供全面的医疗服务。

总的来说，这些医院在肌肉萎缩及相关神经肌肉疾病的治疗方面均具有显著的专业优势和丰富的临床经验。选择合适的医院进行诊治，对于提高治疗效果、改善生活质量具有重要意义。